近亲结婚违背了生物遗传学中的基因分离规律和独立分配规律。其根本原因是这些遗传规律确保了遗传多样性和物种的进化，而近亲结婚打破了这一平衡。
以下是近亲结婚违背的具体规律及其危害的根本原因：
1. **孟德尔遗传规律**：
- **基因分离规律**：生物体的每一对性状都是由两个基因控制的，这两个基因分别来自父母，并在有性生殖中分离，独立地进入配子。
- **独立分配规律**：在形成配子时，每一对基因中的两个成员是独立分配的，不同基因对之间也相互独立。
近亲结婚时，由于近亲之间共享祖先较多，他们可能会继承相同的有害基因，从而增加了这些基因在后代中出现的概率。如果这些有害基因在遗传过程中未能得到分离和重组，就有可能导致后代出现遗传疾病。
2. **近亲婚姻的危害根本原因**：
- **增加遗传疾病的发病率**：近亲结婚增加了携带同一隐性有害基因的概率，这种有害基因在非近亲结婚时可能不会同时出现在后代中。
- **降低后代生存和生育能力**：遗传疾病可能导致后代发育不良、智力障碍、身体畸形等问题，降低生存能力，同时也可能影响生育能力。
- **影响人口素质**：遗传疾病和身体智力缺陷对整个社会的健康和人口素质产生负面影响。
综上所述，近亲结婚违背了基因分离和独立分配规律，其危害的根本原因在于增加了有害基因在后代中出现的概率，降低了后代的生存质量和人口素质。因此，许多国家和地区都有禁止近亲结婚的法律和规定，以维护社会健康和人口质量。
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